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01
OD600的應(yīng)用--幫助了解細(xì)菌的生長(zhǎng)狀態(tài)
OD600是指在600nm波長(zhǎng)處的吸光值,常常被用于分析細(xì)菌生長(zhǎng)和進(jìn)行抗生素敏感性測(cè)試,在細(xì)菌檢測(cè)中,測(cè)量波長(zhǎng)需要選擇在生物材料吸光度最小的范圍內(nèi)。因此,這些細(xì)菌生長(zhǎng)曲線測(cè)量通常使用600-670nm左右的紅色波長(zhǎng)。在細(xì)菌連續(xù)培養(yǎng)過程中,在不同的時(shí)間點(diǎn)檢測(cè)菌液的OD600值,然后以時(shí)間為橫坐標(biāo),OD600為縱坐標(biāo),描繪細(xì)菌的生長(zhǎng)曲線。結(jié)合生長(zhǎng)曲線,可以評(píng)估細(xì)菌所處的生長(zhǎng)階段,進(jìn)而可以確定合適的誘導(dǎo)表達(dá)或收獲的時(shí)間點(diǎn)。
02
OD600 測(cè)量菌液/細(xì)胞濃度的原理
細(xì)菌密度的測(cè)量方式是通過光的散射,也就是看渾濁程度而不是吸光度,光的散射程度反應(yīng)的是細(xì)胞的生物質(zhì)量而不是細(xì)胞個(gè)數(shù),也稱濁度測(cè)量。濁度法測(cè)量非均質(zhì)溶液中是否存在固體顆粒。固體顆??梢允羌?xì)胞、沉淀、聚集體或溶液中存在的任何其他固體物質(zhì)。顆粒會(huì)散射光束中的光子,因此儀器檢測(cè)器會(huì)檢測(cè)到較低的光強(qiáng)度。這種現(xiàn)象與吸光度測(cè)量截然不同,吸光度測(cè)量是指光子被均勻溶液中的特定染料吸收,吸光度和濁度散射的基本區(qū)別如圖 1 所示。
圖1:吸光度和濁度散射的基本區(qū)別, 在吸光度測(cè)定中,由于光被樣品吸收,光電探測(cè)器中的光強(qiáng)會(huì)減弱(A);在濁度測(cè)定中,入射光由樣本中的細(xì)胞/粒子隨機(jī)產(chǎn)生散射。這將導(dǎo)致方向的不確定性。繼續(xù)沿直線傳播的光會(huì)進(jìn)入檢測(cè)器,光強(qiáng)也會(huì)減弱(B)
03
使用不同的設(shè)備測(cè)量OD600細(xì)菌濃度可能得到不同的數(shù)值
對(duì)于具有濁度的樣品,如細(xì)菌溶液、細(xì)胞培養(yǎng)物,測(cè)量的“吸光值”是由于光散射,而不是溶質(zhì)分子光吸收的結(jié)果。由于光散射的程度受系統(tǒng)光學(xué)特性(比色池和儀器出口狹縫之間的距離、單色器光學(xué)特性、狹縫幾何特性等)的影響,使用不同類型的分光光度計(jì)測(cè)量同一樣品時(shí),可能會(huì)得到不同的OD600讀數(shù)。
那我們來看下主要有哪些原因影響濁度的測(cè)量呢?
一是濁度測(cè)量受樣品中顆粒濃度的影響
濁度測(cè)量總是在異質(zhì)樣品中進(jìn)行,一般需要測(cè)量96/ 384 孔板,現(xiàn)在多數(shù)酶標(biāo)儀通常使用相當(dāng)窄的測(cè)量光束。通常情況下,微孔板光度計(jì)的光束直徑不到一毫米,當(dāng)光束穿過96孔板的孔時(shí),測(cè)量光束只能覆蓋樣品體積的很小一部分(圖2)。另外,現(xiàn)代微孔板光度計(jì)的采樣時(shí)間也很短,通常為毫秒級(jí),這些對(duì)于濁度測(cè)量來說并不是最佳選擇會(huì)增加變化。比如液體中的固體顆粒并非處于靜止?fàn)顟B(tài),而是在整個(gè)液體中自由漂浮。因此,當(dāng)樣品中只有少量固體顆粒時(shí),在重復(fù)測(cè)量中,相同數(shù)量的顆粒出現(xiàn)在光束內(nèi)的概率很低。如果樣品中有100 個(gè)顆粒,那么測(cè)量光束區(qū)域內(nèi)的顆粒數(shù)最有可能是1個(gè),但隨機(jī)情況下可能是0個(gè)或2個(gè),甚至3個(gè)。當(dāng)采樣時(shí)間也以毫秒為單位時(shí),液體中顆粒的動(dòng)態(tài)流動(dòng)不會(huì)明顯改變單個(gè)測(cè)量中的這種情況。因此,當(dāng)OD值較低時(shí),檢測(cè)精度可能會(huì)明顯降低,吸光度檢測(cè)的 CVs% 也會(huì)大于正常值。
同樣,當(dāng)樣品中的顆粒數(shù)量增加到非常多時(shí),從顆粒上散射的光子會(huì)撞擊到另一個(gè)顆粒并重新散射。這將導(dǎo)致一些散射光子經(jīng)過多次散射后到達(dá)檢測(cè)器。因此,濁度測(cè)量的線性測(cè)量范圍總是低于吸光度測(cè)量。
二是不同儀器分光光度計(jì)的設(shè)計(jì)影響濁度測(cè)量
吸光度和濁度測(cè)量之間第二個(gè)非常重要的區(qū)別是,不同儀器的光學(xué)設(shè)計(jì)會(huì)影響所得到的OD值(圖 3)。因此,不同廠家生產(chǎn)的微孔板光度計(jì)沒法對(duì)同一樣品給出相同的OD值。這里有兩個(gè)影響因素:一是光電探測(cè)器收集窗口的大小,二是收集狹縫的大小。探測(cè)器窗口越大,收集到的輕微散射光子就越多,因此觀測(cè)到的OD 值就越低。還有一個(gè)主要問題是樣品到檢測(cè)器的距離。如果檢測(cè)器距離樣品很遠(yuǎn),即使是輕微散射光子也會(huì)到達(dá)檢測(cè)器;如果很近,即使是強(qiáng)烈散射光子也會(huì)被檢測(cè)器收集到。因此,這個(gè)距離對(duì)得出的OD 值影響也很大。由于每個(gè)制造商的光學(xué)設(shè)計(jì)不同,這兩個(gè)參數(shù)(距離和探測(cè)器的大?。┰趦膳_(tái)不同的儀器中永遠(yuǎn)不會(huì)相同。這些因素不會(huì)影響吸收測(cè)定,因?yàn)樵谖諟y(cè)定中光束形狀保持不變。檢測(cè)器的大小或距離不會(huì)改變到達(dá)檢測(cè)器的光量。
圖示3:檢測(cè)器收集窗口的大小和與樣品的距離都會(huì)改變所測(cè)得的OD值,因此不同的儀器會(huì)對(duì)相同的樣品給出不同的OD值。檢測(cè)到的OD值差異很容易達(dá)到20-40%。
比如下圖中,在濁度測(cè)定結(jié)果的偏差表明,Multiskan Sky 和 SkyHigh 采用了非常相似的光學(xué)設(shè)計(jì),因此結(jié)果幾乎相同,但Varioskan LUX 和 Multiskan FC 采用了不同類型的光學(xué)器件,因此與Sky和SkyHigh有很大不同,兩者之間也存在明顯差異。但在吸光度測(cè)量方面,所有四款酶標(biāo)儀的測(cè)量結(jié)果完全相同。
圖示4:不同型號(hào)酶標(biāo)儀檢測(cè)吸光度和濁度的比較
因此,對(duì)于OD600測(cè)量,不同酶標(biāo)儀的結(jié)果不能直接進(jìn)行比較。對(duì)于OD600測(cè)量,使用相同型號(hào)的分光光度計(jì)可以保障良好的重復(fù)結(jié)果。而對(duì)于不同酶標(biāo)儀的結(jié)果首先需要使用適當(dāng)?shù)男?zhǔn)曲線進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。
常規(guī)的酶標(biāo)儀檢測(cè)都具備了光吸收檢測(cè)功能,賽默飛多款酶標(biāo)儀具有單獨(dú)模塊用于濁度檢測(cè),比如單功能酶標(biāo)儀FC,配有比色杯模塊的Multiskan SkyHigh 以及多功能酶標(biāo)儀Varioskan LUX等,都是核酸、蛋白質(zhì)、菌液濃度及其他物質(zhì)測(cè)量的多功能儀器,可為用戶提供完善的解決方案。